हालांकि अपने अंतरराष्ट्रीय करियर के दौरान जोहान बोथा को संदिग्ध गेंदबाजी क्रियाओं की समस्याओं का सामना करना पड़ा, फिर भी दक्षिण अफ्रीकी चयनकर्ताओं ने उन्हें अपने मुख्य स्पिनर के रूप में चुना।

उन्होंने 2005 में भारत के खिलाफ खेलने वाले ओडीआई क्रिकेट में शुरुआत की, जिससे निकी बोजे को प्रतिस्थापित किया गया। तब से, बोथा ने ज्यादातर समय सीमित ओवर के खेलों में खेला है। वह मिडिल ओवर्स में विपक्षी टीम को रन बनाने से रोकने में अच्छे हैं, विकेट लेने के बजाय। बहुत से बोथा भी एक अच्छे बल्लेबाज हैं। उदाहरण के लिए, उन्होंने 2006 में ऑस्ट्रेलिया के खिलाफ 46 रन बनाए, भले ही दक्षिण अफ्रीका उस मैच को हार गया।

बोथा ने टीम में अपनी जगह बनाए रखी क्योंकि वह समझदार हैं और जब 2009 में ग्रीम स्मिथ चोटिल हुए थे तो उन्होंने टीम का नेतृत्व किया। स्मिथ के पद से हटने के बाद, उन्हें टी20 कप्तानी सौंपी गई थी। कैरिबियन के 2010 के दौरे के दौरान, बोथा ने साबित किया कि वह अच्छी बल्लेबाजी और गेंदबाजी कर सकते हैं। दूसरे टी20 में, उन्होंने डेविड मिलर के साथ तेजी से 23 रन बनाए और 3 वेस्ट इंडियन विकेट लिए, जिससे उनकी टीम को जीत दिलाने में मदद मिली। बोथा 2009 से आईपीएल में राजस्थान रॉयल्स के प्रमुख खिलाड़ी रहे हैं और टीम की सफलता में योगदान दिया है। उन्हें 2013 में छठे सत्र के लिए दिल्ली डेयरडेविल्स द्वारा भी चुना गया था।

भले ही वह हमेशा उत्कृष्ट नहीं दिख सकते, बोथा ने पर्याप्त कौशल और समझ का प्रदर्शन किया है जिससे प्रतिस्पर्धा में अच्छा प्रदर्शन कर सके और चयनकर्ताओं के विश्वास को उचित ठहराया जा सके।